Secara geografis, wilayah kerja Bea Cukai Surakarta memiliki cakupan yang relatif luas dengan radius wilayah kurang lebih 5.740,81 km2 . Berdasarkan pembagian wilayah kerja yang telah ditetapkan sebagaimana tertuang dalam Peraturan Menteri Keuangan Nomor 188/PMK.01/2016 tentang Organisasi dan Tata Kerja Instansi Vertikal Direktorat Jenderal Bea dan Cukai, Bea Cukai Surakarta memiliki wilayah kerja yang meliputi:

1. Kota Surakarta;
2. Kabupaten Boyolali;
3. Kabupaten Sukoharjo;
4. Kabupaten Karanganyar;
5. Kabupaten Wonogiri;
6. Kabupaten Sragen;
7. Kabupaten Klaten.